Леса занимают 75 920 га (89,1 % от общей площади) и являются доминирующим типом растительности. Согласно ботанико-географическому районированию Восточной Европы, территория Березинского заповедника относится к Евразиатской таежной (хвойно-лесной) области северо-европейской таежной провинции. В пределах Беларуси заповедник территориально приурочен к Верхнеберезинскому геоботаническому району Ошмяно-Минского округа подзоны дубово-темнохвойных (широколиственно-еловых) подтаежных лесов. Формационно-типологическая структура лесов заповедника определяется геоморфологическими особенностями территории и, в меньшей степени, обусловлена влиянием факторов антропогенного характера. Это обеспечивает их высокую флористическую и фитоценотическую гетерогенность.
Леса заповедника представлены четырьмя основными генетическими группами лесных формаций: бореальные хвойные (53,1 % лесопокрытой площади), широколиственные (0,7 %), лиственные болотные (35,6 %) и лиственные вторичные (10,6 %). В общей площади лесов преобладают сосновые фитоценозы (44,3%), формирование которых связано с болотными экосистемами и почвами автоморфного режима увлажнения на водо-разделах реки Березины и ее притоков. Монодоминантные сосняки – боры (9,6 тыс. га) и сосново-еловые леса – субори приурочены к песчаным почвам различного увлажнения. Наиболее широко представлены болотные сосновые леса (19,3 тыс. га). Они произрастают на всех типах болот, образуя обширные массивы. Еловые леса (6,7 тыс. га) сосредоточены вдоль поймы р. Березина и окраин низинных болот. В их составе выделяются три эдафически сопряженные субформации: таежная, неморальная и болотная.
Таежные темнохвойные леса представлены монодоминантными ельниками с хорошо развитым моховым и кустарничковым покровом. Неморальные ельники характеризуются примесью широколиственных пород и произрастают, как правило, на минеральных островах среди черноольховых болот. Болотные еловые леса занимают сырые места с перегнойно-глееватыми и торфянисто-перегнойно-глеевыми почвами. В древесном ярусе их постоянна примесь ольхи черной, березы пушистой.
Широколиственные леса размещены в припойменной части южной ландшафтной зоны заповедника и представлены дубравами и ясенниками.
Дубовые леса (площадь 331 га) относятся к северному зональному варианту еловых дубрав со сложным составом древесного яруса и богатым напочвенным покровом. Ясеневые леса сконцентрированы на заболоченном правобережье р. Березина вблизи оз. Палик. Площадь их небольшая – 177 га. Они образуют сложную по составу и ярусности кондоминантную елово-черноольхово-ясеневую формацию на перегнойно-глеевых почвах.
Лиственные болотные леса представлены двумя основными формациями – черноольховых (12,0 тыс. га) и пушистоберезовых (14,0 тыс. га) лесов. Черноольшаники образуют наиболее крупные массивы в равнинной южной части заповедника, где ярко выражены дренажные свойства густой сети небольших водотоков и р. Березина. В зависимости от эдафических условий и степени обедненности, естественную примесь в древесном ярусе составляют береза пушистая, ель, а по экотопам, примыкающим к минеральным островам – дуб, ясень, клен. Основными местами произрастания пушистоберезовых лесов являются окраины обширных сфагновых болот, а также притеррасная заболоченная часть поймы р. Березина.