Водныя комплексы Бярэзінскага запаведніка разнастайныя і забяспечваюць багатае развіццё прыбярэжнай і воднай расліннасці. Па фітацэнатычнай структуры іх можна падзяліць на наступныя групы: фітацэнозе р. Бярэзіны і яе прытокаў, каналы, старыцы і пойменныя азёры. Найбольш поўна да цяперашняга часу вывучана расліннасць азёр: Домжерицкое, Ольшица, Манец, Плаўна, Палик, Пострежское. Раслінны покрыва азёр складаецца з раслінных супольнасцяў і папуляцый водных (гидрофитов), паветрана-водных і каляводных (гигрофитов) відаў раслін.
Фітацэнозы водна-балотнай расліннасці прадстаўлены 69 відамі, дамінантамі буйных асацыяцый з'яўляюцца: асака вострая, асака омская, прырэчны хвошч, двукисточник тростниковидный і інш. Фітацэнозе паветрана-воднай расліннасці прадстаўлены 5 відамі. Дамінантамі буйных асацыяцый з'яўляюцца: чарот азёрны, трыснёг, мячэўніка узколистный, тростянка овсяницевая. У групу фармацый прымацаванай з якія плаваюць лісцем расліннасці ўваходзяць 8 відаў, дамінантамі асацыяцый з'яўляюцца: гарлачык белы, гарлачык жоўты, горац земноводный, рдест плавае. Пагружаная расліннасць прадстаўлена 11 відамі, дамінантамі асацыяцый з'яўляюцца: уруть колосистая, рдест бліскучы, рдест пронзеннолистный, телорез алоэвидный.
Пануючымі групамі фармацый у азёрах з'яўляецца водна-балотная расліннасць і расліннасць з якія плаваюць на паверхні вады лісцем. За апошнія 20 гадоў істотна змяніўся тып зарастання азёр запаведніка. Назіраецца рэзкае скарачэнне пагружанай расліннасці, якое ў першую чаргу можа быць звязана з ўзняццем ўзроўню вады ў азёрах Плаўна, Ольшица, Манец, Домжерицкое т. к. у апошнія 5 гадоў не адкрываецца шлюз у. д. Кветче і рэзкага скіду вады не адбываецца як у вясновы, так і ў летні перыяд. У цяперашні час запаволены водаабмен. Гэта пагоршыла як хімічныя паказчыкі вады, так і яе празрыстасць, што і адбілася на расліннасці.
Разам з памяншэннем плошчаў пагружанай расліннасці, адбылося павелічэнне плошчаў занятых прымацаванай з якія плаваюць лісцем і, у прыватнасці, асацыяцый скарбонкі жоўтай. Гэта кажа аб працэсах далейшай эўтрафікацыі вадаёмаў. На сучасным этапе развіцця возера Пострежское знаходзіцца ў цеснай сувязі з тым, што кормяць яго балотным масівам – вадазбор і возера займаюць купал (найбольш высокую частку) Пострежского балоты. Гэты рэліктавы вадаём будзе знаходзіцца ў падобным стане вельмі доўгі час, так як минерализиция і кіслотнасць воднай масы настолькі нізкія, што зарастання возера прыпыняецца.
