Сучасны спіс бесхрыбтовых Бярэзінскага запаведніка налічвае 3662 выгляду. Найбольшым таксономическим разнастайнасцю характарызуецца тып Arthropoda (Членістаногія) - 3319 відаў (колькасць у Беларусі ацэньваецца ў 13500-16500 відаў). Адносна багата прадстаўлены тыпы Nemathelminthes (Круглыя чарвякі) (189 відаў), Plathelminthes (Плоскія чарвякі) (72 выгляду), Apicomplexa (30 відаў) і Mollusca (Малюскі) (27 відаў). Прадстаўніцтва іншых тыпаў нязначна: Annelida (Кольчатые чарвякі) налічвае 11 відаў, Ciliophora (Інфузорыі) і Acanthocephala (Скребни) – па 4 віды, Microspora (Микроспоридии) – 3 выгляду, Spongia (Губкі), Coelenterana (Кишечнополостные), Sarcomastigophora (Саркомастигофоры) – па 1 ўвазе.
Краявідная емістасць экасістэм запаведніка ацэньваецца ў 20-22 тыс. відаў беспазваночных, сярод якіх 10-12 тыс прадстаўлена казуркамі.
Прамакрылыя у фауне запаведніка прадстаўлены 4-ма сямействамі, 6-ю відамі; паразитирующими на дробных млекакормячых прадстаўлены атрад вошы. Адзначаны прадстаўнікі 9 сямействаў атрада равнокрылых, складнікі ў лясах запаведніка адну з дамінантных груп насякомых.
З атрада полужесткокрылых да цяперашняга часу вядома 146 відаў з 24 сямействаў. Самы шматлікі атрад насякомых Бярэзінскага запаведніка – жесткокрылые. Цяпер для тэрыторыі запаведніка вядома больш за 700 відаў гэтых насякомых з 46 сямействаў. Самыя аб'ёмныя па складзе відаў – сямейства жужалю (145 відаў), стафилинов (67 відаў), божых каровак (31 від), скрытников (31 від), вусачоў (44 віду), лістаедамі (135 відаў) і шашолак (44 віду). Відавы склад астатніх сямействаў невялікі. Да гэтага часу недастаткова выяўлены відавы склад стафилинид, мягкотелок, малашек, водных полужесткокрылых і некаторых іншых сямействаў.
Самымі шматлікімі відамі для запаведніка ва ўсіх біятопах з'яўляюцца шчалкуны, шашолкі, жужалі і стефилиниды. У асобных біятопаў дамінуюць мягкотелки і лістаедамі (хвойнік багульниковый), божыя кароўкі (хвойнік багульниковый і хвойнік імшысты). Найбольш важнымі ў гаспадарчым дачыненні да (як шкоднікі лесу) з'яўляюцца прадстаўнікі сямействаў вусачоў, лістаедамі, слонік – длинноусый дрывасек, иероглифовый, верасовы, шэры, таполевых і альховыя лістаедамі, каларадскі жук, шчаціністы остроглазый слонік, вялікі сасновы шашолка.
З чешуекрылых да цяперашняга часу для запаведніка вядома больш за 500 відаў з 23 сямействаў. Найбольшая колькасць з іх адносіцца да сямействаў пядениц – 132 выгляду і савок – 105 відаў. Больш за 20 відаў вядома з сямействаў листоверток – 33, огневок-травянок – 21, ширококрылых огневок – 27, мядзведзіц – 22, пестрянок – 22, нимфалид – 27. Сярод прадстаўнікоў чешуекрылых нямала відаў, якія з'яўляюцца шкоднікамі драўняна-хмызняковай расліннасці, ягаднікаў, травостоев. Найбольш масавыя з іх – сасновыя пядзенікі, шаўкапрад-монашенка, зімовая пядзенікі, дубовая листовертка, мініруючая моль – ядуць лісце і ігліцу драўняных парод.
Сярод перепончатокрылых добра вядомы відавы склад толькі асобных сямействаў пилильщиков, наезнікаў, вос і мурашак. Па большасці груп разрозненыя звесткі і няпоўныя. Для запаведніка вядома 111 відаў з сямейства пилильщиков, 23 – з сямейства наезнікаў, 38 – з сямейства мурашак і 81 – з іншых сямействаў. Найбольшае значэнне з пералічаных сямействаў маюць пільшчыкі – шкоднікі іглічных і лісцяных парод, наезнікі, паразітуюць на пилильщиках, чешуекрылых, жескокрылых і полужесткокрылых – шкоднікаў лесу, і мурашкі, сярод якіх вядомыя як драпежнікі, так і почвообразующие віды.
Назіранне – пераважная група ў лясным травастоі. У запаведніку адзначаны прадстаўнікі 34 сямействаў: земнаводныя і крывасмактальныя камары, макрыцы, мошкі, галлицы, камары-толстоножки, гізы, ктыри, тоолкунчики, зеляніцы, гарбаткі, журчалки, большеголовки, ходуленожки, пестрокрылые, муравьевидки, минирующие мушкі, опомизиды, злакавыя мухі, сапраўдныя мухі, тахины і інш. Найбольш шматлікія крывасмактальныя камары. Сярод двукрылых адзначаны фитофаги, галлообразователи, мицетофаги, апыляльнікі раслін, драпежнікі, крывасмок, паразіты, дентратофаги.
