Очень продуктивную работу по охране животного и растительного мира проводит специально созданный в 2002 году отдел охраны животного мира, водоемов и охотничьего хозяйства (численность 22 человека), а также инспектора по охране природы, имеющиеся в штате всех лесничеств.
В помощь инспекторам отдела охраны учреждением приобретено несколько новых фотоловушек. Цифровые лесные фотокамеры оборудованы инфракрасным датчиком движения высокой чувствительности. Благодаря нему камеры обнаруживают резкое изменение температуры окружающей среды, вызванное движением человека в зоне наблюдения. Фотоловушка автоматически снимает фото или видео и отправляет изображения через GSM-сеть на мобильный телефон. Она мгновенно оповещает инспекторов о движении в зоне мониторинга. Посредством работы светодиодной подсветки обеспечивается высокое качество снимков.
За отделом охраны животного мира, водоемов и охотничьего хозяйства закреплены квадроцикл, снегоход, моторная лодка, 4 элетрошокера. Квадроцикл и снегоход решают проблему патрулирования работниками территории в сложнейших условиях. Они проходят там, где другой вид транспорта пробраться уже не может.
Также недавно пополнился автопарк инспекции: куплена новая машина — внедорожник УАЗ для выезда на рейды по территории заповедника. Вышеуказанная модернизация материальной базы отдела охраны соответствует требованиям современного мира. Все это конечно осложнит жизнь браконьерам, но значительно облегчит работу инспекторов и позволит быстрее выявить нарушителей заповедного режима.
Посещение территории заповедника посторонними лицами регламентируется разрешениями, выдаваемыми администрацией заповедника. Разрешен транзитный проезд через территорию заповедника по автомобильным дорогам Минск-Витебск и Докшицы-Лепель. По территории заповедника запрещено движение автотранспорта вне дорог общего пользования.
В заповедной зоне сбор грибов и ягод разрешается только местным жителям. Разрешение на рыбную ловлю кроме них имеют и лица, проживающие в гостиницах, гостевых домиках. На нарушителей заповедного режима составляются протоколы, добытая продукция изымается. После составления протокола решается вопрос о мере наказания.