Оценка состояния и определение естественной динамики растительного покрова в лесных и болотных фитоценозах заповедника является одним из важнейших направлений научных исследований учреждения. Для этих целей в заповеднике в 70-80-е годы заложено более 90 постоянных пробных площадей, охватывающих все основные типы как суходольных, так и болотных лесов.
Программой исследований предусмотрено проведение повторных исследований на каждой пробной площади с интервалом в 5 лет. Таким образом, ежегодно комплекс лесотаксационных и геоботанических работ производится на 15-20 пробных площадях. В текущем году исследования ведутся на более 20 пробных площадях в сосновых, черноольховых и еловых лесах преимущественно в центральной и северной частях заповедника.
Результаты исследований показывают, что леса заповедника не смотря на высокий средний возраст, характеризуются высокой степенью устойчивости древостоев, что является весьма важным для сохранения их биологического разнообразия. В условиях заповедного режима обеспечивается длительное сохранение лесных и болотных фитоценозов с присущим им набором флоры и фауны и господством древесного яруса.